NB193 - ANÁLISE PROTEÔMICA EM LARGA ESCALA – TURMA DMS
Créditos: 6
Horário: Segunda a sexta das 8 - 18H00
Local/Sala: IB10 (Prédio da CPG-IB, Bloco O, 2o piso)
Período de oferecimento: Férias de Verão (de 29/01 a 09/02/2018)
Vagas: 15
Mínimo de alunos: 5
Responsável: Daniel Martins de Souza
Estudantes especiais: Não aceita
Programa:
Os alunos terão um treinamento teórico e prático nas técnicas mais difundidas em estudos de proteoma em larga escala como a eletroforese de duas dimensões e espectrometria de massas. Ainda, cromatografia líquida, SDS-PAGE e análise de dados in silico serão abordados. Os alunos interessados terão a oportunidade de discutir com o professor(a) responsável pela disciplina e orientador(a) sobre realizar a parte prática da disciplina utilizando as amostras de estudo de suas teses. Os dados obtidos poderão eventualmente integrar suas teses e artigos científicos.
Cronograma:
(T) Introdução à Disciplina
(E) Preparação de amostras 1
(E) Preparação de amostras 2
(T) Aplicações Proteômica
(T) Cromatografia Líquida
(S) Projeto em Proteômica
(T) Espectrometria de Massas
(E) LC-MS
(S) Pré-apresentação Seminários
S) Apresentação Seminários
(T) Aquisição de dados em MS e Identificação
(E) Processamento de dados
(T) Proteômica Quantitativa
(E) SRM/Skyline TOF-MRM
(S) Apresentação Seminários
(T) Estatística em Proteômica e
Biologia de Sistemas
(E) Processamento de dados
(S) Preparação dos projetos
(E) Biologia de Sistemas
(S) Apresentação Projeto em Proteômica
T: Teórica; E: Experimental; S: Seminários
Bibliografia:
Martins-de-Souza, Daniel. Shotgun Proteomics: Methods and Protocols. Vol. 1156, 1st Edition. New York: Humana Press, Springer, 2014 - Zhou, Ming; Veenstra, Timothy. Proteomics for Biomarker Discovery. Vol. 1002, 1st Edition. New York: Humana Press, Springer, 2013. Kinter, Michael; Sherman, Nicholas E. Protein sequencing and identification using tandem mass spectrometry. New York, Wiley-Interscience, 2000 - Marzzoco, Anita; Torres, Bayardo B. Bioquímica Básica. 3a. Edição. Rio de Janeiro: Guanabara, 2007.