BA001 - TÓPICOS EM BIOLOGIA ANIMAL I – TURMA EZS
Tema: Evolução de Vertebrados
Créditos: 2
Horário: 14 - 18:00 hs
Local/Sala: IB08
Período de oferecimento: Segundas e Sextas-feiras (De 05 a 29/01/2018)
Vagas: 12
Mínimo de alunos: 05
Responsável: Eleonore Zulnara Freire Setz
Estudantes especiais: aceita - solicitar autorização do professor responsável e seguir instruções
Programa:
Objetivos: Atualização em evolução de vertebrados, a partir de leituras de artigos recentes sobre o tema focalizando descobertas de fósseis ou pesquisas com vertebrados viventes, seus caracteres diagnósticos, sua morfologia funcional, interpretações de seu modo de vida, reorganização de sua filogenia. Métodos e técnicas inovadoras para resolução de questões de evolução de vertebrados.
Conteúdo programático:
Discussões de leituras de artigos científicos recentes (em especial, Science e Nature, que são curtos e bem escritos) sobre pesquisas com vertebrados, fósseis ou viventes, caracteres diagnósticos de grupo, descrição de sua morfologia e interpretação funcional, e rearranjos filogenéticos, tanto com base morfológica como genética. Os métodos e técnicas e suas inovações também fazem parte das análises das leituras. O programa resultará do levantamento e seleção dos artigos pelo grupo. A avaliação será baseada na presença, leitura dos artigos e participação nas discussões, e uma curta monografia individual final fazendo um apanhado reflexivo do conjunto das leituras, tratando dos grupos, assuntos, técnicas e metodologias empregadas.
Cronograma:
Na primeira aula, os alunos vão procurar artigos envolvendo vertebrados nas revistas Science e Nature no período compreendido entre janeiro de 2017 e janeiro de 2018. Com base neste levantamento serão escolhidos, lidos e discutidos dois artigos por aula (são concedidas duas horas para leitura e duas horas para discussão - uma por artigo cada). Ao final do período os alunos deverão compor uma curta monografia individual final fazendo um apanhado reflexivo do conjunto das leituras, tratando dos grupos, assuntos, técnicas e metodologias empregadas.
Bibliografia:
Artigos de Science e Nature envolvendo vertebrados e literatura de Zoologia de Vertebrados de apoio (Pough et al; Hildebrand e Goslow, Kardong, por exemplo).
BA027 - SISTEMÁTICA FILOGENÉTICA – TURMA ARG
Créditos: 4
Horário: Segunda a sexta 8 – 18H00
Local/Sala: IB06 (Prédio da CPG-IB, Bloco O, 1o piso), de 29/01 a 31/01/2018
IB05 (Prédio da CPG-IB, Bloco O, 1o piso), de 01/02/ 09/02/2018
Período de oferecimento: Férias de Verão (de 29/01 a 09/02/2018)
Vagas: 20
Mínimo de alunos: 1
Responsável: André Rinaldo Senna Garraffoni
Colaboradores: Daniele Polotow Geraldo
Estudantes especiais: Não aceita
Programa:
Serão revistos todos os passos para se fazer uma análise filogenética baseados em dados morfológicos, desde conceitos básicos sobre homologia, tipos de caracteres, definições de plesiomorfia/apomorfia/simplesiomorfia/sinapomorfia/monofilético/parafilético, codificação, até montagem da matrix de caracteres e análise dos dados em programas específicos. Além disso, serão abordados questões teóricas e filosoficas sobre sistemática e classificação dos animais.
Cronograma:
29/01 - 8:00-10:00 Apresentação da disciplina/ Histórico e caracterização da Sistemática
10:20-12:00 Histórico e caracterização da Sistemática
14:00-16:00Caracteres compartilhados (sinapomorfias, grupos monofilético)
16:20-18:00Exemplos de sinapomorfias e grupos monofiléticos
30/01 - 8:00-18:00 Leitura de artigo
31/01 - 8:00-10:00 Discussão do artigo lido, Homologia (definição teórica e operacional)
10:20-12:00Procura de artigos/Construção de hipóteses de homologia
15:00-17:00Codificação de caracteres
17:20-18:00Exemplo codificação de caracteres
01/02 - 8:00-18:00 Leitura de artigo
02/02 - 8:00-10:00 Discussão do artigo lido, Reconstrução de cladogramas – “método manual”
12:00-12:00 Exemplo de Reconstrução de cladogramas – “método manual”
14:00-16:00Reconstrução de cladogramas – “método computacional”
16:20-18:00Exemplo de Reconstrução de cladogramas – “método computacional”
05/02 - 8:00-18:00 Leitura de artigo
06/02 - 8:00-10:00 Discussão do artigo lido, Filogenia Estatística
10:20-12:00Prática
14:00-16:00Classificação Linneana e PhylocodeTeórica
16:20-18:00Exemplo de Reconstrução de cladogramas – “método computacional”
07/02 - 8:00-12:00Leitura de artigo
14:00-16:00 Discussão do artigo lido
08/02 - 8:00-18:00Preparação semanário
09/02 - 8:00-18:00Apresentação/discussão da disciplina
Bibliografia:
Amorim, D. S. 2002. Fundamentos de sistemática filogenética. Editora Holos, Ribeirão Preto.
de Pinna, M. C. C. 1991. Concepts and tests of homology in the cladistics paradigm. Cladistics, 7:367-394.
Farris, J. S. 1983. The logical basis of phylogenetic analysis. In: Platnick, N. I.; Flunk, V.A. (Eds.), Advances in cladistics, vol. 2,
Columbia. University Press, New York, p.7-36.
Hennig, W. 1966. Phylogenetic systematics. University of Illinois Press, Urbana.
Hull, D. L. 1988. Science as a process: an evolutionary account of the social and conceptual development of science. University of Chicago Press, Chicago.
Kitching, I. J.; Forey, P. L.; Humphries, C. J.; Williams, D. M. 1998.
Cladistics: the theory and practice of parsimony analysis. Oxford University Press, second edition.
Nelson, G.; Platnick, N. I. 1981. Systematics and biogeography: cladistics and vicariance. Columbia University Press, New York.
Nixon, K. C.; Carpenter, J. M. 1993. On outgroups. Cladistics 9:413-426.
Schuh, R. T.; Brower, A. V. Z. 2009. Biological systematics: principles and applications. Cornell University Press, Ithaca
Wiley, E. O.; Lieberman, B. S. 2011. Phylogenetics: theory and practice of phylogenetic systematics, 2 ed. Wiley-Blackwell, Hoboken.
Williams, D. M.; Forey, P. L. 2004. Milestones in systematics. CRC Press.